跻身国际肿瘤前沿研究第一梯队 西安交大在《自然》集中发表6篇论文

移动版  2020-02-17 00:01  来 源:网络整理  字号:

  西安新闻网讯(西安报业全媒体记者 姜泓 任娜)2月16日,记者获悉,,由西安交大生物信息计算团队参与的6篇论文日前在《自然》杂志齐发,首创多项面向全基因组大数据的高精度计算技术,是迄今最全面的癌症多组学研究成果。这标志着西安交大生物信息计算团队跻身国际肿瘤前沿研究第一梯队。 本文来自织梦

  近日,国际顶级期刊《自然》(Nature)集中发表了国际癌症基因组联盟(ICGC)泛癌全基因组分析协作组(PCAWG)完成的6篇论文。PCAWG还在《自然生物技术》《生物通讯》发表了研究成果。西安交通大学电信学部生物信息计算团队牵头,联合双聘院士、合肥工业大学杨善林教授团队和吉因加科技团队组成联合攻关组,全面参与了PCAWG的工作。

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  据了解,该组论文设计泛癌全基因组数据画像、肿瘤体细胞突变的路径图谱、非编码区的驱动突变特征、基因组结构突变的特征模式、复现肿瘤的演化历程、多组学荟萃的RNA变化规律等内容。《自然》杂志同期配发了新闻综述和科技评论,称赞上述研究在广度和深度上都实现了重大突破,首创了多项面向全基因组大数据的高精度计算技术,以前所未有的规模进一步揭示了癌症的复杂性,在癌症组学的多个领域都取得了一批重要发现和具有指南意义的结论,是迄今最全面的癌症多组学研究成果,并指出,6篇论文和PCAWG的其他重要成果将成为进一步探寻癌症的分子遗传学机制的钥匙,科学界从此获得了致癌分子遗传学机制的崭新视角和未来研究更加清晰的方向。

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  上述论文中,西安交大生物信息计算攻关团队的署名作者包括王嘉寅教授、杨善林院士(双聘)、张选平教授等,攻关团队参与了体细胞突变检测新技术组、驱动突变与功能解释组的工作,包括数据测试与质控、针对人群/种群数据的参数优化、高特异性检测、非常规变异检测模型和算法的研发等。 织梦好,好织梦

  据介绍,西安交通大学电信学部生物信息计算研究队伍由赵仲孟、王嘉寅教授于2012年开始逐步组建。在电信学部双聘院士杨善林教授的指导下,团队重点围绕“数据特征精准挖掘、特征关联耦合分析、演化模式预测应用”三步曲中的科学难题和应用瓶颈问题,开展数据驱动的肿瘤临床辅助决策模型、算法及其应用等领域研究。团队近年来已连续在国际顶尖期刊发表重要研究成果20余篇,累计发表SCI论文近60篇。

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